Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Kcnn1Q9EQR3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Kcnn1Q9EQR3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Kcnn1Q9EQR3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Kcnn1Q9EQR3 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms