Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms