Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms