Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxp4Q9DBY0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms