Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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