Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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