Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms