Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sgms2Q9D4B1 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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