Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms