Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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