Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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