Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms