Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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