Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms