Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms