Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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