Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms