Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms