Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Apobec3Q99J72 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Apobec3Q99J72 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms