Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan1Q99J59 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms