Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms