Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atl3Q91YH5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atl3Q91YH5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms