Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrit1Q8K099 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrit1Q8K099 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrit1Q8K099 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrit1Q8K099 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrit1Q8K099 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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