Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Znf628Q8CJ78 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms