Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LgsnQ8CIX8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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