Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm9955Q8CEJ8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm9955Q8CEJ8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm9955Q8CEJ8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm9955Q8CEJ8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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