Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc178Q8CDV0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc178Q8CDV0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc178Q8CDV0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc178Q8CDV0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc178Q8CDV0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc178Q8CDV0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc178Q8CDV0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc178Q8CDV0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc178Q8CDV0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc178Q8CDV0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc178Q8CDV0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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