Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc187Q8C5V8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc187Q8C5V8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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