Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac7Q8C2B3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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