Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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