Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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