Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms