Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan9Q8BJU2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms