Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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