Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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