Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms