Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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