Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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