Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
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