Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms