Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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