Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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