Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms