Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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