Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms