Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Sall3Q62255 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Sall3Q62255 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms