Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cd47Q61735 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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