Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms