Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Kctd1-201ENSMUST00000025992 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms