Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms